Obok wydziałów w AGH działają następujące jednostki pozawydziałowe:
a) prowadzące lub wspierające kształcenie
- Międzywydziałowa Szkoła Inżynierii Biomedycznej
- Studium Języków Obcych
- Studium Wychowania Fizycznego i Sportu
b) obsługujące i wspierające działalność dydaktyczną lub naukowo-badawczą Uczelni
- Akademickie Centrum Materiałów i Nanotechnologii
- Międzynarodowe Centrum Mikroskopii Elektronowej dla Inżynierii Materiałowej
- Centrum e-Learningu
- Biblioteka Główna
- Akademickie Centrum Komputerowe „Cyfronet" AGH
- Szkoła Ochrony i Inżynierii Środowiska im. Walerego Goetla
- Wydawnictwa AGH
- Centrum Transferu Technologii
- Akademicki Inkubator Przedsiębiorczości
- Centrum Problemów Energetycznych
- Centrum Międzynarodowej Promocji Technologii i Edukacji AGH - UNESCO
- Uniwersytet Otwarty AGH
c) inne jednostki organizacyjne
- Uczelniane Centrum Informatyki
- Ośrodek Historii Techniki z Muzeum
- Miasteczko Studenckie AGH
- Basen AGH
- Jednostki Administracji Centralnej w Pionach
